El laboratorio de Hidrobiología es un laboratorio de Docencia, Investigación y Extensión de la Escuela de Biología que tiene el propósito fundamental de desarrollar estudios en las áreas de ecología y biodiversidad de las comunidades presentes en los sistemas acuáticos de aguas epicontinentales (lenticas y loticas) y marinas y de su relación con el cambio climático.
El laboratorio se inicio en el 2012 a partir de la infraestructura y espacio físico del antiguo Laboratorio de Limnología. Se localiza en el primer piso del edificio de “Ingeniería de Petróleos viejo” en la sede central de la Universidad y actualmente se encuentra adscrito al Grupo Centro de Estudios e Investigaciones Ambientales (CEIAM).
El laboratorio cuenta con una colección de plancton, perifiton y macroinvertebrados acuáticos procedentes de los sistemas loticos y lenticos del departamento de Santander la cual esta registrada ante el Instituto Alexander von Humboldt y adscrito al Museo de Historia Natural de la Universidad Industrial de Santander.