El CINBIN inició labores el 27 de marzo de 1986 como el Laboratorio de Investigación en Microbiología Industrial (LIMI). Posteriormente, debido a su acelerado crecimiento e insuficiencia de espacio físico, fue trasladado a la Sede de la UIS en Guatiguará, donde sirvió de escenario para la docencia y la investigación. En los primeros meses del año 2002 se pensionó la Dra. Graciela Chalela Álvarez, quien fuera no solamente su fundadora y Directora, sino profesora de Microbiología de la Escuela de Biología.
En abril de 2002, el Laboratorio de Biología Molecular de la Escuela de Biología (LBM), creado el 27 de marzo de 1995 y dirigido por el Dr. Jorge Hernández Torres, fue fusionado con el CINBIN. Esta alianza dio lugar al Centro de Innovación en Biotecnología Industrial y Biología Molecular, bajo la dirección del Dr. Jorge Hernández Torres. En reemplazo de las funciones de investigación, extensión y docencia de la Dra. Graciela Chalela Álvarez, fue nombrada la profesora Mariela Carreño de Arango, M.Sc., hasta principios de 2006, año de su retiro.
En marzo de 2006, ingresó el Dr. Jorge Luis Fuentes Lorenzo como nuevo profesor de Microbiología y permaneció en el Centro hasta noviembre de 2007, año en que se trasladó el Laboratorio de Microbiología del CINBIN a la Sede Principal de la UIS. Desde entonces, el CINBIN reorientó sus líneas de investigación, principalmente hacia trabajos en Biología Molecular y Bioinformática. No obstante, con la vinculación de nuevos investigadores, el Centro ha ido recuperando su capacidad operativa en todos los aspectos de su Misión.
Con las instalaciones del CINBIN como Sede, en abril de 2002 se inscribió en Colciencias el Grupo de Investigación en Biotecnología Industrial y Biología Molecular. El grupo ha estado conformado por profesores, biólogos y estudiantes de la UIS, con el propósito de convertir el CINBIN en un Centro de referencia en el nororiente colombiano y en el futuro, a nivel nacional.
La vocación principal del grupo ha sido la formación de nuevos investigadores en programas de pregrado y de posgrado, quienes hoy están esparcidos por todo el mundo. El escenario de enseñanza-aprendizaje han sido los laboratorios y, en el contexto científico, los proyectos de investigación. Entre otros, se encuentran:
- Estudios de filogenética molecular y biogeografía en palmas, anfibios y onicóforos.
- Códigos de barras de ADN en microorganismos.
- Uso de los microorganismos como productores de sustancias de interés industrial.
- Implementación de procesos de control de calidad de alimentos cárnicos.
- Estudios de bioinformática y biología estructural.
- Producción enzimática de biodiésel.
- Uso de transcriptómica de nueva generación para explorar la función génica.
- Búsqueda de alternativas para solucionar problemas de contaminación ambiental.
- Transferencia de tecnología de la Universidad hacia el sector productivo.
